2020年以來，各級漁業行政主管部門貫徹落實十部門聯合印發的《關于加快推進水產養殖業綠色發展的若干意見》，推動水產養殖從量的增長到質的提升，產業綠色發展取得顯著成效。
科學規劃促進可持續發展，依法確權保障漁民權益。養殖水域灘涂規劃制度和養殖證制度是水產養殖業發展的基本制度，2020年年初，農業農村部印發通知，指導各地全面推進養殖水域灘涂規劃編制發布和養殖證核發工作。目前全國已有6個省級、257個地市級和1544個縣級人民政府頒布實施本級養殖水域灘涂規劃，核發《水域灘涂養殖證》13萬本，確權登記水域、灘涂面積約441.5萬公頃，為穩定漁業基本養殖水域發展空間、保障養殖漁民合法權益、促進水產養殖業綠色發展奠定了堅實基礎。
生態健康養殖全面推進，轉型升級步伐加快。啟動實施水產綠色養殖“五大行動”，因地制宜大力推廣工廠化和池塘循環水養殖、海水立體養殖、大水面生態增養殖等健康養殖技術。拓展養殖生產空間，支持發展深遠海養殖、稻漁綜合種養、鹽堿水生態養殖。持續開展全國水產健康養殖示范創建活動，全年共創建國家級水產健康養殖示范場 1009家、漁業健康養殖示范縣12個，打造一批水產養殖綠色發展典范。
現代水產種業不斷壯大，產業基礎更加穩固。發布新中國成立以來首個《中國水產種業發展報告（1949－2019）》，從管理體制、制度建設、科研學術、推廣應用、產業發展等方面全景式展示70年來水產種業發展成效。壯大水產種業體系，創建國家級水產原良種場86家。推動新品種選育，依法審定新品種達229個。組織相關水產科研院校和育種企業開展南美白對蝦聯合育種，促進政產學研用一體發展。
水生動物防疫持續強化，疫病防控能力不斷提高。水產苗種產地檢疫制度首次在全國范圍全面實施，各地已確認漁業官方獸醫7766人，設置檢疫申報點1304個，全年出具電子《動物檢疫合格證明》4861份，檢疫水產苗種433億尾。開展重大水生動物疫病監測預警，發布《2020中國水生動物衛生狀況報告》和《2020我國水生動物重要疫病狀況分析》，組織開展鮭鱒魚等寄生蟲監測和重大疫病風險評估，提升重大水生動物疫病防控和應急處置能力。完善“全國水生動物疾病遠程輔助診斷服務網”，不斷提升水產養殖病害防治服務水平。
